维生素：人体：蛋白质

质子：原子：电子

病人：医院：病房

软件：手机：应用

气囊：汽车：油门

维生素和蛋白质均是人体生存的必要物质，第一词和第三词均与第二词构成必要条件的对应关系。

A项：质子和电子均是形成原子的必要物质，第一词和第三词均与第二词构成必要条件的对应关系，与题干逻辑关系一致，当选；

B项：病房指病人居住的房间，病房是医院的组成部分，但有的小型的医院（比如社区医院）就没有病房，因此病房不是医院的必要组成部分，与题干逻辑关系不一致，排除；

C项：软件和应用均为手机的组成部分，第一词和第三词均与第二词构成组成关系，但软件不是手机的必要组成部分，如非智能手机中不需要手机软件，与题干逻辑关系不一致，排除；

D项：气囊和油门均为汽车的组成部分，第一词和第三词均与第二词构成组成关系，但气囊不是汽车的必要组成部分，与题干逻辑关系不一致，排除。

故本题选A。