高中 | 第1节 重组DNA技术的基本工具 题目答案及解析

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选择性必修三 生物技术与工程

第三章 基因工程

第1节 重组DNA技术的基本工具

为研究果蝇$\rm K$基因的功能,科研人员运用$\rm CRISPR$基因编辑技术“敲除”了$\rm K$基因。

$\rm CRISPR$系统由向导$\rm RNA$$\rm Cas9$核酸酶组成,向导$\rm RNA$可与$\rm DNA$的一条链通过                                                                                  原则结合,$\rm Cas9$酶能将与之结合的双链$\rm DNA$切割,如图$\rm 1$所示。$\rm Cas9$酶与基因工程使用的限制酶作用的差异是                                                                                 

[["

碱基互补配对 $\\rm Cas9$核酸酶不具有识别$\\rm DNA$分子中特定核苷酸序列的作用,切割的是与向导$\\rm RNA$ 结合的$\\rm DNA$中的磷酸二酯键,使$\\rm DNA$双链断裂;限制酶能够识别双链 $\\rm DNA$分子的特定核苷酸序列,切割的是$\\rm DNA$每一条链中特定部位的磷酸二酯键,使$\\rm DNA$双链断裂

"]]

$\rm CRISPR$系统由向导$\rm RNA$$\rm Cas9$核酸酶组成,向导$\rm RNA$可与$\rm DNA$的一条链通过碱基互补配对原则结合,$\rm Cas9$酶能将与之结合的双链$\rm DNA$切割。基因工程使用的限制酶能够识别双链 $\rm DNA$分子的特定核苷酸序列,并且使每一条链中特定部位的磷酸二酯键断开。$\rm Cas9$核酸酶不具有识别$\rm DNA$分子中特定核苷酸序列的作用,需要向导$\rm RNA$进行定位后,切割与之结合的双链$\rm DNA$中的磷酸二酯键,使$\rm DNA$双链断裂。

为后续筛选$\rm K$基因“敲除”的果蝇,在$\rm K$基因$\rm DNA$断裂位点插入红色荧光蛋白基因($\rm RFP$)需提供携带有红色荧光蛋白基因的供体质粒。

①应选用                 处理图$\rm 2$所示的质粒和红色荧光蛋白基因,以构建供体质粒,同时避免质粒自连。

②将$\rm Cas9$酶基因、向导$\rm RNA$基因和供体质$\rm RFP$基因粒导入果蝇的                 中,若检测到红色荧光,则表明$\rm K$基因可能被成功“敲除”,该受精卵发育成的果蝇即为$\rm F$₀代果蝇。

[["$\\rm BamHI$$\\rm NotI$","受精卵"]]

①为了构建供体质粒,同时避免质粒自连,应选用两种不同的限制酶切割红色荧光蛋白基因和质粒。分析图$\rm 2$可知:$\rm KpnI$会切开卡那霉素抗性基因,不利于后续筛选;$\rm DraIII$会切开复制原点,影响质粒的复制;使用$\rm HindIII$与其他酶一起切割质粒时会使质粒上的启动子缺失,影响基因的表达,所以选用$\rm BamHI$$\rm NotI$

②将构建好的表达载体导入果蝇细胞中时,应选用受精卵作为受体细胞,因为动物的受精卵具有全能性,能发育成完整个体。

为确认$\rm K$基因是否被成功“敲除”,科研人员进行了如下实验:

①科研人员用图$\rm 3$中的引物$\rm I$$\rm II$$\rm III$$\rm F$₀代果蝇$\rm DNA$进行$\rm PCR$并电泳检测(大于$\rm 10kb$片段单次$\rm PCR$无法完成扩增)。若敲除成功,则观察到的不同个体电泳条带可能有两种情况:                                (长度单位:$\rm kb$),出现这两种情况的原因是                                                                                

②近年来,科研人员又发现了一种检测基因的方法$\rm ——Cas12a$酶法。该酶类似$\rm Cas9$能够在向导$\rm RNA$的作用下,在特定位点剪切目标$\rm DNA$之后,还发挥非定向切割单链$\rm DNA$的功能(如图)。用该方法检测敲除是否成功并排除“脱靶”的方法是:利用                序列设计向导$\rm RNA$,取待检测细胞克隆导入                和报告分子,观测指标是                

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$\\rm 4kb$(或$\\rm 3.5kb$);$\\rm 4kb$$\\rm 5.5kb$(或$\\rm 3.5kb$$\\rm 5.5kb$);$\\rm RFP$序列按图中方向正向插入断裂区域,敲除成功的$\\rm F_{0}$代果蝇可能是敲除杂合体或纯合体、或敲除成功的$\\rm F_{0}$代果蝇插入了一个或两个$\\rm RFP$基因(或者$\\rm RFP$序列按图中方向反向插入断裂区域,敲除成功的$\\rm F_{0}$代果蝇可能是敲除杂合体或纯合体、或敲除成功的$\\rm F_{0}$代果蝇插入了一个或两个$\\rm RFP$基因);目标$\\rm DNA$;向导$\\rm RNA$基因和$\\rm Cas12a$酶基因;是否产生绿色荧光

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①若$\rm K$基因敲除成功并导入$\rm RFP$基因,$\rm F$₀代果蝇能发出红的荧光,由于$\rm K$基因在果蝇内成对存在,$\rm K$基因可能敲除了一个($\rm K$基因敲除杂合子)或两个($\rm K$基因敲除纯合子),断裂位点也不一定都能插入$\rm RFP$,且插入的$\rm RFP$方向不确定,所以要分情况分析。

情况一:按照图中的方向将$\rm RFP$基因序列正向插入断裂位置,若果蝇为$\rm K$基因敲除纯合子且在$\rm K$基因$\rm DNA$断裂位点都插入了$\rm RFP$,由于大于$\rm 10kb$片段单次$\rm PCR$无法完成扩增,$\rm PCR$只能获得引物$\rm I$和引物$\rm III$之间$\rm 4kb$的片段;若果蝇为$\rm K$基因敲除纯合子但只有一条染色体上的$\rm K$基因断裂位点插入$\rm RFP$,或者果蝇为$\rm K$基因敲除杂合子,则除了获得引物$\rm I$和引物$\rm III$之间$\rm 4kb$的片段,还可以获得未插$\rm RFP$基因时或未被敲除的$\rm K$基因上引物$\rm I$与引物$\rm II$之间$\rm 5.5kb$的片段。

情况二:将图中$\rm RFP$基因序列反向插入断裂位置,若果蝇为$\rm K$基因敲除纯合子且在$\rm K$基因$\rm DNA$断裂位点都插入了$\rm RFP$,由于大于$\rm 10kb$片段单次$\rm PCR$无法完成扩增,$\rm PCR$只能获得引物$\rm II$和引物$\rm III$之间$\rm 3.5kb$的片段;若果蝇为$\rm K$基因敲除纯合子但只有一条染色体上的$\rm K$基因断裂位点插入$\rm RFP$,或者果蝇为$\rm K$基因敲除杂合子,则除了获得引物$\rm II$和引物$\rm III$之间$\rm 3.5kb$的片段,还可以获得未插$\rm RFP$基因时或未被敲除$\rm K$基因时引物$\rm I$与引物$\rm II$之间$\rm 5.5kb$的片段。

$\rm Cas12a$酶法类似$\rm Cas9$能够在向导$\rm RNA$的作用下,在特定位点剪切目标$\rm DNA$之后,还发挥非定向切割单链$\rm DNA$的功能。所以应利用特定位点剪切的目标$\rm DNA$序列,根据碱基互补配对的原则,设计向导$\rm RNA$,取待检测细胞克隆导入向导$\rm RNA$基因、$\rm Cas12a$酶基因和报告分子。在细胞体内,向导$\rm RNA$与目标$\rm DNA$结合,然后$\rm Cas12a$酶在向导$\rm RNA$结合位点剪切目标$\rm DNA$,然后$\rm Cas12a$酶发挥非定向切割单链$\rm DNA$的功能,剪切报告分子,报告分子中的淬灭基团和绿色荧光基团分离,绿色荧光基团发出绿色荧光,所以可以通过观察是否产生绿色荧光判断敲除是否成功并排除“脱靶”。

为进一步研究$\rm K$基因功能,科研人员做了如下表的实验,由此推测$\rm K$基因的功能是                                 

子代果蝇个数(只)
野生型♂$\rm \times $野生型♀$\rm 103$
野生型♂$\rm \times K$基因“敲除”果蝇♀$\rm 109$
$\rm K$基因“敲除”果蝇♂$\rm \times $野生型♀$\rm 0$
[["

维持雄性果蝇的正常育性

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野生型♂$\rm \times $野生型♀、野生型♂$\rm \times K$基因“敲除”果蝇♀两组相比,子代个体数相近,说明$\rm K$基因“敲除”不影响雌性个体的育性;而$\rm K$基因“敲除”果蝇♂$\rm \times $野生型♀杂交没有子代,说明$\rm K$基因“敲除”影响雄性个体的育性,即$\rm K$基因的作用是维持雄性果蝇的正常育性。

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