刑罚：改造罪犯：处罚

格言：指导言行：语句

审计：收入分配：监督

比喻：生动描写：借喻

科研：本质规律：活动

刑罚是指审判机关依据刑事法律对罪犯所施行的法律制裁。刑罚是处罚的一种，二者为种属关系；刑罚的功能是改造罪犯，二者为功能关系。

A项：格言是指含有劝诫和教育意义的话。格言是语句的一种，二者为种属关系；格言的功能是指导言行，二者为功能关系，与题干逻辑关系一致，当选；

B项：审计是指由专设机关依照法律对国家各级政府及金融机构、企业事业组织的重大项目和财务收支进行事前和事后的监督、检查。审计是监督的一种具体形式，二者为种属关系；但审计的功能是监督和检查收入分配，收入分配是审计的对象，二者为作用对象的对应关系，与题干逻辑关系不一致，排除；

C项：借喻是比喻的一种，直接借比喻的事物来代替被比喻的事物，被比喻的事物和比喻词都不出现。借喻和比喻是种属关系，但词语顺序与题干相反；比喻的功能是生动描写，二者为功能关系，与题干逻辑关系不一致，排除；

D项：科研是活动的一种，二者为种属关系；但科研的功能是探索本质规律，本质规律是科研的对象，二者为作用对象的对应关系，与题干逻辑关系不一致，排除。

故本题选A。