重金属：轻金属：铝

沙尘暴：龙卷风：积雨云

立体图形：平面图形：三角形

环境污染：生态破坏：水土流失

灭活疫苗：狂犬病疫苗：破伤风疫苗

根据金属的密度区分，密度大于的是重金属，密度小于的是轻金属，重金属和轻金属，二者为矛盾关系，铝是轻金属，二者为种属关系。

A项：沙尘暴与龙卷风都属于天气现象之一，二者为反对关系，积雨云是一种云，与题干逻辑关系不一致，排除。

B项：图形分为立体图形和平面图形，二者为矛盾关系，三角形是平面图形，二者为种属关系，与题干逻辑关系一致，当选。

C项：全球三大危机包括：资源短缺、环境污染、生态破坏，环境污染和生态破坏，二者为反对关系，水土流失是生态破坏的一种现象，二者为种属关系，与题干逻辑关系不一致，排除。

D项：狂犬病疫苗是灭活疫苗，二者为种属关系，与题干逻辑关系不一致，排除。

故本题选B。